Thời kỳ Tây Ban Nha
Động cơ thực ban đầu của người Tây Ban Nha, lại chỉ đơn thuần về thương mại. Người Tây Ban Nha ban đầu coi Philippines là bước đệm để can thiệp đến sự giàu có của bán đảo Đông Ấn (những quần đảo dồi dào về gia vị), nhưng, ngay cả sau khi người Bồ Đào Nha và Hà Lan đều nhìn nhận lại tiềm năng, người Tây Ban Nha vẫn duy trì sự hiện diện của họ trên quần đảo.
Các nhà thám hiểm và khai phá người Bồ Đào Nha, nhà thám hiểm Ferdinand Magellan đứng đầu cuộc đột phá đầu tiên của Tây Ban Nha đến Philippines. Khi ông đổ bộ vào Cebu vào tháng 3 năm 1521; Một thời gian ngắn sau,ông trên hòn đảo Mactan gần đó . Sau khi vua Philip II (người được đặt tên cho các hòn đảo) đã phái thêm ba cuộc thám hiểm nữa đều kết thúc trong thảm họa, ông đã gửi đi Miguel López de Legazpi , người thành lập khu định cư Tây Ban Nha đầu tiên, tại Cebu, vào năm 1565. Thành phố Tây Ban Nha, Manila được thành lập vào năm 1571 và đến cuối thế kỷ 16, hầu hết các khu vực ven biển và vùng đồng bằng thấp từ Luzon đến miền bắc Mindanao đều nằm dưới sự kiểm soát của Tây Ban Nha. Tu sĩ diễu hành với binh lính và sớm hoàn thành việc chuyển đổi tín ngưỡng bản địa thành Công giáo La Mã. Môt trăm phần người dân địa phương thuộc chính quyền Tây Ban Nha đều phải cải đạo. Nhưng người Hồi giáo ởMindanao và Sulu, người mà người Tây Ban Nha gọi là Moros , không bao giờ bị chính quyền Tây Ban Nha khuất phục hoàn toàn .
Moros , một vài dân tộc thiểu số theo Hồi giáo của Mindanao , Palawan , các Quần đảo Sulu , và các đảo phía nam khác của Philippines . Chiếm khoảng 5 phần trăm dân số Philippines, họ có thể được phân loại theo ngôn ngữ.
Sự cai trị của Tây Ban Nha trong 100 năm đầu tiên được thực hiện ở hầu hết các khu vực. Thông qua một hình thức canh tác thu thuế và được gọi là Encomienda (hệ thống pháp lý mà vương quốc Tây Ban Nha đã cố gắng sử dụng để vơ vét tài sản của người dân bản địa). Đối xử tệ với những người địa phương cống nạp và đóng thuế, thậm chí khi cải đạo, họ bị bỏ mặc bởi các đức cha tôn giáo bởi encomenderos (người thu thập cống phẩm bản địa), cũng như thường xuyên xảy ra các khoản thất thoát từ tham nhũng, khiến người Tây Ban Nha từ bỏ hệ thống vào cuối thế kỷ 17. Toàn quyền, do chính vua bổ nhiệm, bắt đầu bổ nhiệm các thống đốc dân sự và quân sự của riêng mình để cai trị trực tiếp.
Chính quyền trung ương ở Manila sự dụng hệ thống chính trị thời trung cổ cho đến thế kỷ 19, và hệ thống chính quyền này có ảnh hưởng rất mạnh đến nỗi thường được ví như một vị vua độc lập. Chính thể này thống trị toàn cõi thuộc địa, hay tòa án tối cao, là tổng đội trưởng của các lực lượng vũ trang, và được hưởng đặc quyền tham gia vào thương mại vì lợi nhuận tư nhân.
Manila, trung tâm hành chính, thống trị các đảo và không chỉ là thủ đô chính trị. Nó còn quản lý việc giao thương, các thuyền buồm thương mại với Acapulco , Mex., Đảm bảo tính ưu việt thương mại của Manila là ưu tiên hàng đầu. Việc trao đổi lụa Trung Quốc lấy bạc Mexico không chỉ hấp dẫn những người Tây Ban Nha đang tìm kiếm lợi nhuận, mà còn nhanh chóng thu hút được một lượng lớn Cộng đồng người Hoa . Người Trung Quốc, mặc dù là nạn nhân của các vụ thảm sát định kỳ dưới bàn tay của những người Tây Ban Nha, vẫn kiên trì và sớm thiết lập sự thống trị của thương mại tồn tại qua nhiều thế kỷ.
Manila cũng là thủ đô giáo hội của Philippines. Toàn quyền là người đứng đầu dân sự của nhà thờ ở các đảo, nhưng tổng giám mục đã tranh cãi với ông về uy quyền chính trị. Vào cuối thế kỷ 17 và 18, tổng giám mục, người cũng có tư cách pháp nhân của thống đốc, thường xuyên giành chiến thắng. Tăng cường quyền lực chính trị, mệnh lệnh tôn giáo, bệnh viện và trường học Công giáo La Mã, và nhờ đó các giám mục có được sự giàu có, quyền lực. Các khoản tài trợ và phát minh của Hoàng gia là sự hình thành cốt lõi cho tài sản của những tổng giám mục này. Và nhiều ưu thế đã bị lạm dụng cho việc tư nhân. Chế độ lúc này đã có sự phân cấp cực rõ ràng, điều sẽ làm ảnh hưởng sâu sắc đến sự phân cấp tại thời điểm hiện tại.
Sức mạnh của nhà thờ không chỉ đơn giản đến từ sự giàu có và địa vị chính thức. Các linh mục và tu sĩ có nhiệm vụ đồng hóa ngôn ngữ trong số giáo dân Tây Ban Nha, và ở các tỉnh lực lượng tu sĩ, truyền giáo đông hơn các quan chức dân sự. Vì vậy, họ là một nguồn thông tin vô giá cho chính quyền thuộc địa. Mục tiêu đồng nhấ văn hóa của các giáo sĩ Tây Ban Nha không gì khác hơn là Kitô giáo hóa và Tây Ban Nha hoàn toàn của người Philippines. Trong những thập kỷ đầu tiên của công việc truyền giáo, các tôn giáo địa phương bị đàn áp mạnh mẽ; tín ngưỡng cũ không được dung thứ. Nhưng khi giáo dân Kitô giáo tăng số lượng và lòng nhiệt thành của các giáo sĩ suy yếu, việc ngăn chặn việc giữ gìn tín ngưỡng và phong tục cổ xưa dưới trang phục Công giáo La Mã ngày càng khó khăn. Do đó, ngay cả trong lĩnh vực tôn giáo, văn hóa Philippines trước khi bị Tây Ban Nha đô hộ đã không hoàn toàn bị phá hủy.
Các thể chế kinh tế và chính trị cũng bị thay đổi dưới tác động của Tây Ban Nha nhưng có lẽ kém triệt để hơn trong lãnh vực tôn giáo. Các linh mục đã cố gắng di chuyển tất cả mọi người vào cụm hoặc làng được cai trị xung quanh bởi các nhà thờ lớn. Nhưng các mô hình nhân khẩu học phân tán của barangay cũ phần lớn vẫn tồn tại. Các Datu vẫn giữ gìn bản sắc riêng của mình, sâu thẳm trong họ vân là ý thức tự tôn dân tộc cao. Đây cũng chính là yếu tố mà Tây Ban Nha không bao giờ đồng hóa hoàn toàn thuộc địa của mình và Mỹ sau này đã rút được kinh nghiệm đó.
Công nghệ nông nghiệp thay đổi rất chậm cho đến cuối thế kỷ 18, khi canh tác nương rẫy dần nhường chỗ cho việc canh tác định canh, thâm canh hơn, một phần dưới sự hướng dẫn của các giáo sỹ. Hậu quả kinh tế xã hội của các chính sách của Tây Ban Nha đi kèm với sự thay đổi này đã củng cố sự khác biệt về giai cấp. Các datu và các đại diện khác của tầng lớp quý tộc cũ đã tận dụng việc đưa ra khái niệm sở hữu đất đai tuyệt đối của phương Tây để tuyên bố là cánh đồng của chính họ được canh tác bởi những người được kế thừa của họ, mặc dù quyền sử dụng đất truyền thống đã bị giới hạn trong việc sử dụng.